<HTML>
<HEAD>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-7">
<TITLE>Biological concepts and systems, PhS Dept., Univ. of Athens</TITLE>
</HEAD>
<BODY BGCOLOR="#F0FCDF">
<H1>
Βιολογικές έννοιες και συστήματα (2011)<BR>
(<A HREF="http://www.phs.uoa.gr/">ΜΙΘΕ, Παν. Αθηνών</A>, 6o Εξάμηνο)
</H1>
<P>
<UL>
<LI><A HREF="#Description">Περιεχόμενο</A>
<LI><A HREF="#Material">Εκπαιδευτικό υλικό</A>
<LI><A HREF="announcements.html">Ανακοινώσεις</A> <B>22/10 Εξετάσεις Οκτωβρίου</B>
<LI><A HREF="whatsnew.html">What's new</A> <B>14/06 Υλη, Λύσεις θεμάτων Φεβρουαρίου 2010, Βιβλίο Atlan</B>
<LI><A HREF="#Links">Διάφορες διευθύνσεις</A>
</UL>
<P>
<HR>
<P>
<A NAME="Description">
<H2>Περιεχόμενο</H2>
<P>
<H3>Στόχος</H3>
Στόχος του μαθήματος είναι αφ' ενός η εξοικείωση των φοιτητών με τη θεματολογία και μερικές βασικές έννοιες βιολογικών συστημάτων, αφ' ετέρου η επαφή με τις τεχνικές μοντελοποίησης και η μελέτη in vivo ενδεικτικών πειραματικών μοντέλων. Επισκοπούνται κατ' αρχήν οι έννοιες και τα προβλήματα της θεωρίας συστημάτων όπως αυτή εφαρμόζεται σε βιολογικά προβλήματα με έμφαση σε μοντέρνα ή/και εξειδικευμένα θέματα όπως αυτο-οργάνωση, αυτονομία, αυτοποίηση, ανάδυση συμπεριφοράς. Παρουσιάζονται επίσης εν συντομία κάποιες κεφαλαιώδεις προσεγγίσεις και προβλήματα της συμπεριφορικής και εξελικτικής βιολογίας που αποτελούν συστηματικό στόχο μοντελοποίησης, όπως η κοινωνιοβιολογία και το πρόβλημα των ειδών. Σε πρακτικό επίπεδο, δίνονται παραδείγματα μοντελοποίησης, πειραματισμού και μελέτης με μαθηματικές, υπολογιστικές και δικτυακές μεθόδους και γίνεται σύγκριση και αξιολόγηση των διαφόρων μεθόδων.
<P>

<H3>Διδάσκων</H3>
<PRE>
	<B>Ελπίδα Τζαφέστα</B>
	Αν. Καθ. Πανεπιστημίου Αθηνών
	Τμήμα Μεθοδολογίας, Ιστορίας και Θεωρίας της Επιστήμης
	Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
	Πανεπιστημιούπολη, Ανω Ιλίσια 15771
	Τηλ. 210-727 5522,
	     210-727 5504
	Fax. 210-727 5530

	<IMG ALIGN=MIDDLE SRC="../Images/mail.gif"> <A HREF="mailto:etzafestas@phs.uoa.gr"><EM>etzafestas@phs.uoa.gr</EM></A>
	<IMG ALIGN=MIDDLE SRC="../Images/www2.gif"> <A HREF="http://www.softlab.ece.ntua.gr/~brensham"><EM>http://www.softlab.ece.ntua.gr/~brensham</EM></A>
</PRE>

<P>

<H3>Ωρολόγιο πρόγραμμα</H3>
Πέμπτη 9-12πμ, Αίθουσα Ε.
<BR>
Για τυχόν αλλαγές, έκτακτες παραδόσεις και το εργαστήριο, κοιτάξτε τις <A HREF="announcements.html">ανακοινώσεις</A>

<P>
<H3>Οργάνωση</H3>
Οι φοιτητές πρέπει να συμπληρώσουν τα εξής παραδώσουν τις εξής ασκήσεις/εργασίες:<BR>
<OL>
<LI><B>Υποχρεωτικά</B>: Γραπτή εξέταση (40%-80%).<BR><P>
<B>Ελεύθερη επιλογή από τα παρακάτω ώστε να συμπληρωθούν 10 μονάδες</B>:
<LI>Τρεις υπολογιστικές ασκήσεις (από 20%). Θα γίνει ένα τουλάχιστον τρίωρο επίδειξης και εξάσκησης στο εργαστήριο. Εν συνεχεία οι φοιτητές θα πρέπει να εργασθούν μόνοι τους.
<LI>Μία βιβλιογραφική εργασία (20%). Οι φοιτητές επιλέγουν ένα θέμα σύμφωνα με τα ενδιαφέροντά τους σε συνεννόηση με το διδάσκοντα που τους προτείνει ένα σχετικό άρθρο. Η εργασία συνίσταται σε κριτική αναφορά (review) του άρθρου, σε συσχετισμό και με άλλο συνοδευτικό υλικό. Περίπου 5-6 σελίδες.
<BR>
</OL>
<P>

<HR>
<P>
<A NAME="Material">
<H2>Εκπαιδευτικό υλικό</H2>
<P>
<B><I>Για την πρόσβαση στο παρακάτω υλικό που σημειώνεται με το κλειδάκι 
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg">, απαιτείται η χρήση του username/password που έχει δοθεί στο μάθημα. <U>Απαγορεύεται να σταλεί με email το username/password, ή να κυκλοφορήσει ηλεκτρονικά με άλλο τρόπο. Οποιαδήποτε παραβίαση ασφαλείας στο site θα έχει σαν αυτόματη συνέπεια τη διακοπή της πρόσβασης.</U></I></B>
<UL>
<P>
<LI><H3>Υλη του μαθήματος</H3>
<P>
Συνιστάται η μελέτη των κεφαλαίων 12,13,15,19,21 από το βιβλίο του Κριμπά (βλ.
<A HREF="Announcements.html#Exam">σχετική ανακοίνωση</A>), των σημειώσεων και
των λυμένων ασκήσεων. Τα θέματα της εξέτασης θα είναι του ίδιου τύπου με τις λυμένες ασκήσεις.
Στην εξέταση επιτρέπεται ελεύθερα η χρήση όλου του υλικού του μαθήματος.
<P>
<LI><H3>Διαφάνειες, σημειώσεις και συμπληρωματικό υλικό (readings)</H3>
<UL>
<LI>Σημειώσεις (δυαδικά δίκτυα, πληθυσμιακά μοντέλα, δυναμικά συστήματα)<BR>
<A HREF="protected/CourseNotes.pdf">PDF, 17 σελίδες, 520K</A>
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><B>27/05</B><BR>
<LI>Διαφάνειες (παιχνίδια)<BR>
<A HREF="protected/SlidesGames.pdf">PDF, 8 σελίδες, 160K</A>
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><B>27/05</B><BR>
<LI>Παλιά θέματα και λύσεις
<UL>
<LI><A HREF="protected/ExamSolutionsFeb10.pdf">Φεβρουάριος 2010</A>
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><IMG SRC="../Images/new.gif"> <B>14/06</B>
</UL></UL>
<P>

<LI><H3>Βιβλιογραφικές εργασίες</H3>
<A HREF="EssayAssignments.html">Θέματα</A> <B>27/05</B><BR>
<A HREF="EssayInstructions.html">Οδηγίες</A> <B>27/05</B>
<P>

<LI><H3>Υπολογιστικές εργασίες</H3>
<A HREF="Assignment/index.html">Περιγραφή του συστήματος</A> <B>27/05</B><BR>
<A HREF="ProjectInstructions.html">Εκφωνήσεις και οδηγίες</A> <B>27/05</B><BR>
<A HREF="protected/Game.zip">Ο κώδικας</A> <IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><B>27/05</B>
<P>

<LI><H3>Λυμένες ασκήσεις</H3>
<A HREF="protected/Exercises.pdf">PDF, 10 σελίδες, 220K</A>
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><B>27/05</B><BR>
<P>

<LI><H3>Readings</H3>
<UL>
<LI>Βιβλίο Henri Atlan<BR>
<A HREF="protected/HenriAtlanBook.pdf">PDF, 124 σελίδες, 3.77M</A>
<IMG SRC="../Images/lock2.jpg"><IMG SRC="../Images/new.gif"> <B>14/06</B>

</UL>

<LI><H3>Γενική βιβλιογραφία</H3>
Προσεχώς...

</UL>

<P>

<HR>
<P>
<A NAME="Links">
<H2>Διάφορες διευθύνσεις ανά την υφήλιο</H2>
Προσεχώς...

<P>
<HR>
<EM>Τελευταία ενημέρωση 14 Ιουνίου 2011.</EM><BR>
<A HREF="mailto:etzafestas@phs.uoa.gr">
<EM>Στείλτε μου mail (etzafestas@phs.uoa.gr)</EM></A><BR><BR>

</BODY>
</HTML>

�